Fabrice,
A mon humble avis, il me semble y avoir une certaine confusion, dans ton message, entre la notion de fertilité (valable pour un potager) et celle de biodiversité.
Par exemple, en France métropolitaine, la région qui accueille le plus de biodiversité est la zone méditerranéenne, qui n'est que rarement ce qu'on appelle "fertile" : il y a peu d'humus, la pluviométrie parfois violente, l'activité humaine, les coupes de bois, le surpâturage, etc, ont érodé les sols, quelquefois jusqu'à la roche nue.
Un sol "naturel", dans la nature, n'est pas en déséquilibre : il est argileux, caillouteux, sec, humide, calcaire, acide, au soleil, à l'ombre des arbres, avec tel climat (froid, chaud, pluviométrie), tel ou tel relief. Des plantes de différentes tailles y poussent sans qu'il soit besoin de l'enrichir, de l'amender, de l'arroser.
"Faire" un jardin, c'est l'observer, mais aussi observer les paysages alentour, et faire des choix pour l'accompagner en douceur dans sa dynamique. Par chez moi (Quercy), les orchidées "arrivent" si on a des pelouses sèches (pas du gazon, juste "de l'herbe"), plutôt rases, ensoleillées et pas arrosées, etc Pas besoin que ce soit fertile.